統一通信對多種通信方式的整合往往要涉及到軟件、硬件、移動設備、固定設備，而其標準和協議是不一樣的，所以這種整合本身就存在難度。

在IP電話和桌面應用方面，主要是SIP和H.323協議;移動視頻主要是H.324M;監控也有H.323、SIP和專有協議以及MEPG2、MEPG4、H.264等各種視頻格式;視頻會議則以H.323為主;2G電話和普通電話有G.711和G.722等各種音頻格式。這里面涉及到很多種通信、控制、語音和視頻協議，通信信令方面也有很多種。這些協議之間的產品和應用，要進行融合和統一，需要供應商有很強的底層技術支撐能力。

在對這些系統進行整合之后，統一通信本身也需要形成一個標準化體系以方便企業部署，否則沒有標準化的支持，企業用戶就難以保護自己的投資，會對部署統一通信心存疑慮。不過就目前來看，其標準化進程不盡如人意，標準化尚處于起步階段。統一通信的標準化不僅和技術相關，也和各廠商對統一通信所持有的理念有關。

一方面，在統一通信系統中，協議尚未做到兼容性，各種協議標準還在發展之中;另一方面，不同廠家的系統在技術標準的選用及協議的兼容性方面還難以做到相互兼容，這將對以后業務的兼容性、互操作性帶來問題。在終端協議方面，終端協議的多樣化，將會帶來終端版本的升級、維護等諸多問題。另外，在統一通信中，各個主流通信廠商普遍采用了很多的私有協議，造成了各廠家設備之間的互聯互通問題，增加運營成本和復雜性，不利于統一通信市場的健康發展。有關專家表示，統一通信標準從目前相對混亂的狀態走向成熟，至少要花費五年甚至十年的時間。

由于SIP協議開發簡單、靈活，很容易增加新業務，擴展性強，所以受到越來越多企業的支持，SIP很可能會成為統一通信中的事實標準，不過SIP協議本身也還在發展過程中，而且這一進程還是比較漫長的。

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