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倒計(jì)時1天|“您能治好我的孩子嗎?”

企業(yè)動態(tài)
戴爾科技集團(tuán)作為一家全球領(lǐng)先的科技公司,憑借其先進(jìn)的科技水平和全方位的產(chǎn)品技術(shù)組合,未來定能夠?yàn)門Gen,乃至人類的生命事業(yè)帶去無限可能。

 

 倒計(jì)時1天|“您能治好我的孩子嗎?”

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我們都知道生病得治

醫(yī)生根據(jù)病因?qū)ΠY下藥

病體很快就能恢復(fù)健康

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可并非所有疾病都能得到治療

比如一些“罕見病

由于病因不明根本無從治起

病患只能日復(fù)一日遭受病痛的折磨

 

所幸當(dāng)今時代

先進(jìn)科技加持下的醫(yī)療事業(yè)取得了長足進(jìn)步

以往一些無法確診的罕見病

經(jīng)過精準(zhǔn)醫(yī)療逐漸明朗

為病患送去了希望的曙光

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介紹戴爾科技與TGen的故事

看科技如何打造

Real Precision Medicine

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更多醫(yī)療案例講解

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10.25·北京國家會議中心

歡迎您的到來!

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生命困局

面對罕見病和癌癥的無奈

 

 

過去18年來Basil Pais和妻子都在努力為他們的女兒尋找病因。剛出生的時候,她是一個健康的寶寶,可3個月后,問題出現(xiàn)了:

她的體重增加緩慢,并且得了葡萄球菌感染。隨著時間推移,由于進(jìn)行性的神經(jīng)肌肉問題,她已經(jīng)不能走路、說話,其間還經(jīng)歷了無數(shù)次感染和手術(shù)。更遺憾的是,醫(yī)生無法弄清原因所在

“我們與不同州的多位專家合作,但測試結(jié)果都不樂觀。”Pais說道。

 

 


根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)的定義,罕見病為患病人數(shù)占總?cè)丝?/strong>0.65‰-1‰的疾病。由于不是普通的疑難雜癥,盡管醫(yī)生覺察出病人的蹊蹺,卻難以尋找對癥的良藥。

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此外,癌癥,作為美國第二大死因,每年造成超過59萬美國人死亡,并且由于醫(yī)療水平有限,很快它就會超越心血管疾病成為美國致死率最高的病癥。


面對罕見病、癌癥等病患數(shù)量的激增,如何利用科技精準(zhǔn)快速地尋找出病因為病患實(shí)施精準(zhǔn)治療減輕痛苦成為醫(yī)療行業(yè)迫切需要解決的問題

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生命博弈

精準(zhǔn)醫(yī)療+基因測序


 

近年來,隨著科技的發(fā)展,各行各業(yè)發(fā)展逐步精細(xì)化,醫(yī)療領(lǐng)域亦是如此,精準(zhǔn)醫(yī)療的概念逐漸深入人心。

 

 

精準(zhǔn)醫(yī)療

利用先進(jìn)的智能化數(shù)字技術(shù)(例如大數(shù)據(jù)、人工智能、物聯(lián)網(wǎng)等),基于醫(yī)學(xué)前沿科技對大樣本人群與特定疾病類型進(jìn)行生物標(biāo)記物的分析與鑒定、驗(yàn)證與應(yīng)用,從而精確尋找疾病的原因和治療的靶點(diǎn),并對疾病不同狀態(tài)和過程進(jìn)行精確分類,最終實(shí)現(xiàn)對疾病和特定患者進(jìn)行個體化精準(zhǔn)治療的目的提高疾病診治與預(yù)防效益

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作為下一代診療技術(shù)精準(zhǔn)醫(yī)療較傳統(tǒng)診療方法有很大的技術(shù)優(yōu)勢。與傳統(tǒng)診療手段相比,精準(zhǔn)醫(yī)療具有精準(zhǔn)性便捷性且發(fā)展?jié)摿Ω?span style="color: #000000; caret-color: #ff0000; font-family: 微軟雅黑, 'Microsoft YaHei';">。

 

 

目前,全球精準(zhǔn)醫(yī)療更多地集中在人類對惡性腫瘤的早期診斷和治療上,基于個體基因檢測的腫瘤個體差異化治療成為重要趨勢

 

傳統(tǒng)的藥物治療由于沒有考慮到個體基因的差異性,在用藥效果上會產(chǎn)生很大的差異,而基因檢測可以幫助醫(yī)生基于基因分析選擇潛在的靶向治療藥物

 

 

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TGen挑戰(zhàn)罕見病
生命依賴于數(shù)據(jù)

 

TGen——美國翻譯基因組研究所,是一家位于亞利桑那州的非營利性醫(yī)療研究機(jī)構(gòu),在其兒童罕見疾病治療中心,每一天都有生物信息學(xué)家、遺傳學(xué)家和臨床醫(yī)生進(jìn)行基因測序,以確診各種罕見疾病幫助更多人更好地生存

 

 

倒計(jì)時1天|“您能治好我的孩子嗎?”
TGen對精準(zhǔn)醫(yī)療的探索為更多患者帶來了更好的治療方法。要想做到這一點(diǎn),需要能夠處理大量數(shù)據(jù),即將數(shù)據(jù)移動到需要的位置,并對數(shù)據(jù)進(jìn)行安全管理和智能處理。

TGen總裁兼研究主任Dr.Jeffrey Trent表示

 

如果每分鐘記錄60個字,每天8小時,那么記錄一個人類基因組需要花費(fèi)50時間,所用紙張堆起來有自由女神像那么高但是,一次拼寫錯誤就有可能導(dǎo)致疾病產(chǎn)生

 

倒計(jì)時1天|“您能治好我的孩子嗎?”

 

 

TGen知道,治療罕見病最好的辦法是利用大數(shù)據(jù)技術(shù),建立和完善罕見病數(shù)據(jù)庫,使其成為治療罕見病的重要依據(jù)。同時,通過大數(shù)據(jù)和人工智能算法,判斷哪些是正常的,哪些是有問題的,并建立多種知識庫,加速精準(zhǔn)醫(yī)療的實(shí)現(xiàn)。

但大數(shù)據(jù)的使用也給計(jì)算帶來了壓力。為了準(zhǔn)確診斷疾病,TGen需要強(qiáng)大的高性能計(jì)算(HPC)系統(tǒng)快速運(yùn)行極其復(fù)雜的算法,以分析患者多個TB(1TB=1024GB)的遺傳數(shù)據(jù)和分子數(shù)據(jù)。

 

單個基因組的測量就要處理多達(dá)4TB的數(shù)據(jù)基因組測序可能需要數(shù)周才能完成。”TGen首席信息官James Lowey說,“確定我們排序的數(shù)千個基因的作用是非常困難的。”

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為了有效開展工作,TGen需要一個能夠提供必要服務(wù)器性能存儲容量網(wǎng)絡(luò)帶寬和可用性的HPC集群

 

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計(jì)算力為精準(zhǔn)醫(yī)療提供強(qiáng)大動力

 

 

精準(zhǔn)醫(yī)療和基因測序都是數(shù)據(jù)驅(qū)動的科學(xué),離不開對海量基因組、影像學(xué)、臨床數(shù)據(jù)的分析和處理。HPC系統(tǒng)的強(qiáng)大計(jì)算能力和精準(zhǔn)性成為罕見病或癌癥病患的生命支撐

 

出于對戴爾科技集團(tuán)的信任,TGen研究團(tuán)隊(duì)選擇了戴爾易安信的HPC集群,來收集Basil Pais家族的基因測序數(shù)據(jù),根據(jù)PYCR2基因突變對其女兒進(jìn)行診斷。

 

 

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此前,波士頓兒童醫(yī)院的研究人員曾在美國人類遺傳學(xué)雜志上發(fā)表了一篇同樣病例的論文,隨后TGen團(tuán)隊(duì)便與波士頓兒童醫(yī)院開展了合作,共享生物樣本,以深入了解這種罕見的疾病。

“由于對相關(guān)科學(xué)有了進(jìn)一步理解,并且擁有性能強(qiáng)大的戴爾易安信HPC集群,我們才能夠重啟這方面工作,更深入分析家族的基因序列數(shù)據(jù)。”Ramsey說道,“我們最終找到了基因突變與這名兒童所患疾病的關(guān)系,當(dāng)時只從兩個家族發(fā)現(xiàn)這種疾病,由此表明它是多么地罕見。”

 

雖然女兒的病仍無法完全治愈,但Basil Pais覺得負(fù)擔(dān)解除了:“我們等了18年才得到確診這對我們來說意義非凡。”他說,“即使現(xiàn)在還在治療過程中,我們覺得已經(jīng)邁出了第一步,邁出了讓我們女兒得到所需幫助的第一步。”

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很顯然,TGen和波士頓兒童醫(yī)院所做的工作為未來確診更多類似疾病鋪平了道路,而戴爾易安信HPC出色的計(jì)算能力也為精準(zhǔn)醫(yī)療的推進(jìn)提供了強(qiáng)大動力

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為滿足工作上的需求,TGen部署了基于戴爾易安信基因組數(shù)據(jù)分析平臺的HPC群集

 

該群集采用了96個戴爾易安信PowerEdge M420服務(wù)器刀片和1536個Intel®Xeon®E5-2470 v2處理器,全部插裝在三個戴爾易安信PowerEdge M1000e機(jī)箱中這樣能夠利用非常緊湊的占地空間為TGen提供強(qiáng)大功能
此外,TGen還采用了機(jī)架頂部的戴爾易安信Networking S4810交換機(jī)來支持集群組件通信。

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事實(shí)上,一開始TGen并沒有選擇HPC。

2012年,早期的研究人員對Pais家族的基因進(jìn)行了測序,不過他們沒有找到導(dǎo)致兒童疾病的基因突變。“我們意識到需要有更多可用的數(shù)據(jù)和更好的技術(shù)來進(jìn)一步推動基因測序工作。”Ramsey說道。

幸運(yùn)的是,在戴爾易安信幫助下組建的基因組數(shù)據(jù)分析平臺TGen提供了一個高度可擴(kuò)展的集群,可幫助其加快分析速度,更快地創(chuàng)建個性化診治方案。

 

利用戴爾易安信構(gòu)建的系統(tǒng)TGen科學(xué)家和醫(yī)生可以在更短的時間內(nèi)處理更多數(shù)據(jù)來更快地得出結(jié)論。從而,在未來幫助更多“Pais家庭”贏得更多生命時間。

 

 

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TGen+戴爾易安信,碰撞出哪些火花?

▉ 效率獲得提高。TGen研究人員利用戴爾易安信 HPC集群,開發(fā)定制化治療方案的時間至少比以前短了一周

現(xiàn)在,TGen的集群每月可以支持CPU運(yùn)行100萬個小時,這有助于提高研究數(shù)量和速度。

▉ 擴(kuò)展性獲得優(yōu)化。現(xiàn)在,TGen的兒童罕見疾病中心可以使用戴爾易安信 HPC集群開展更多新的研究工作,并且能夠更快地執(zhí)行基因測序,高效處理不斷增加的數(shù)據(jù)量。


 

戴爾易安信強(qiáng)大的高性能計(jì)算系統(tǒng)大大提高了TGen的研究速度,拓展了其研究空間,為無數(shù)生命贏得了時間,也讓無數(shù)家庭重燃生命希望。

在全面推行精準(zhǔn)醫(yī)療的道路上,TGen仍需砥礪前行,戴爾科技集團(tuán)作為一家全球領(lǐng)先的科技公司,憑借其先進(jìn)的科技水平和全方位的產(chǎn)品技術(shù)組合,未來定能夠?yàn)?/strong>TGen乃至人類的生命事業(yè)帶去無限可能 

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責(zé)任編輯:張燕妮 來源: 戴爾易安信解決方案
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